剧情简介：
小智等人在竹兰位於小波镇的别墅，为了准备参加青少年杯而不断特训。想要休息一下的小光提议，到传说有奇特的"岩蛇神奇宝贝"大岩蛇存在的无人岛去玩。在大家沿著海岸边的洞窟探险时，突然遭到大岩蛇攻击。虽然勉强逃过一劫，小智他们却与艾莉丝还有小光走散了。在返回海岸的路上，巨大的大岩蛇再度来袭！！面对兼具地上、岩石属性的大岩蛇，水系的水水獭与波加曼合力击退敌人！但是，又有更多大岩蛇冒了出来！！此时，美洛耶塔开始唱歌，它的模样却……
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